MLP Elements of Harmony est un jeu de puzzle simple et amusant. Sélectionnez trois éléments identiques pour créer une chaîne d’énergie pour les détruire. Sur son chemin, la chaîne énergétique détruira également tous les éléments qui ont un point commun. Les éléments que vous devez détruire sont toujours affichés en bas de l’écran. Lorsque certains éléments sont détruits, de nouveaux éléments sont créés. Le temps est contre vous, mais vous devez vous dépêcher et détruire les éléments nécessaires le plus rapidement possible afin de passer au niveau suivant. Une fois le temps épuisé, le jeu est terminé. Plus vous détruisez d’éléments, plus vous pouvez obtenir de points.